第27章
总之身体是小孩，大脑却是大人的名侦探江户川柯南在米花町悄悄地诞生，剧情开始展开，但琴酒完全没有感知到。他关注的是明美和雪莉。论坛成员要保持真酒人设，在谈到柯南的时候自然不能肆无忌惮，所以琴酒一直没有把柯南这个名字和小学生联系起来，他觉得大概是什么普通侦探，反正这个世界上的侦探多得要命。
柯南转入帝丹小学到小哀出现之间过了多少时间没有明确说过，柯南世界的时间非常古怪，所以即使少年侦探团已经组建起来了，琴酒还没有看到明美要跑路的苗头。这样的话，赤井要什么时候回日本？远在美国的贝尔摩德也说没有见过赤井，自从那次易容成杀人魔诱出赤井后，她就不打算那么干了。干掉银色子弹的任务还是交给别人吧。
即使现在的琴酒不再是原来的卷王，他也没那么多时间跑到美国去找赤井，在这他比较想享受那种主动撞上来被他戏耍的感觉。因此他一定要走这种套路，在赤井惊愕的目光中出现！他都能想象出到时候赤井的样子了。
所以他要不要给明美施加一些压力，然后让她更早地想要带着雪莉离开黑衣组织。但再一想，这样说不定只是明美早点死而已，赤井又不是明美的守护精灵，明美一召唤就飞过来救她——这又不是玛丽苏漫画。
琴酒不在乎明美是死是活，但他不希望失去这个时间节点衡量标杆，所以只能放弃这富有吸引力的想法。
其实赤井和几个fbi同事已经到达了日本，有的假装来旅游，有的假装来找工作。虽然在漫画中，赤井的出场要等到file.287，在感官上觉得过了很长时间，但以柯南时间的进程又应该没多少时间。赤井要在大巴上第一次和少年侦探团会面，但其实他早就到日本了，暗中调查了一番，甚至已经注意到了柯南和小哀。他接触柯南的一个原因就是为了保护小哀，他直接接触小哀不太好，所以通过柯南得到小哀的信息。
赤井来了日本后，发现他原来去过的组织的据点都不见了。非常符合黑衣组织的行事风格。但是令人惊讶的是，琴酒的安全屋居然还在用！琴酒这种本来就总是换安全屋的人，居然没有在他暴露之后把安全屋炸了。
赤井绝对不会相信琴酒旧情难忘这种鬼话，琴酒是故意想要引fbi入瓮吧？
另外赤井还无意间看见琴酒和将军在一起过周末，他没想到过了两年，琴酒居然还和将军有来往。琴酒这是在和他分手后和将军交往了？不，感觉将军本来就是黑衣组织的成员比较合理。还在卧底的时候，赤井就听说过，琴酒只找组织内部的人。
那当时他还以为将军是萍水相逢的路人，那岂不是这两人一直骗他？怪不得，他当时就觉得将军怪怪的，果然不是普通人！
另外他觉得琴酒和以前也不一样，现在多了松弛感，感觉都像换个人了。琴酒他居然不加班了！赤井回忆起以前在琴酒手底下干活的时候，简直不分昼夜，睡车上也是经常的事，还是后来他强烈要求休假，才换来了单休。但现在，琴酒不仅坚决执行双休，而且晚上也能不工作就不工作。
这还是琴酒吗？他被洗脑了？
fbi来日本是为了再战黑衣组织的，所以赤井没有把过多精力放在琴酒身上。他曾经从明美那里听到过雪莉工作的制药公司，但他去调查制药公司的时候，发现从表面上看，这家公司非常正规，没有研制什么违法的东西，而且也绝对没有雇佣未成年。
赤井也不想再见到明美，结果却收到了明美的短信。
第28章
“大君如果这次能够逃离组织的话，能作为真正的男朋友和我交往吗？”
赤井按掉了屏幕，双手插进夹克衫口袋里，靠在墙上叹了口气。他在几天前就收到了这条短信，但一直没有回复。他到天台上来抽根烟，又看了一遍短信。他回到日本，就没想过再打破明美安静的生活，却没想到明美会主动联系他。
明美想要离开黑衣组织……赤井一直清楚明美不喜欢组织里的生活，也觉得那样善良的女孩不适合待在黑暗中。他更惊讶的是明美居然有这样的胆量。只有在黑衣组织中待过，见识过其中的黑暗，才能真正明白黑衣组织有多么可怕，正因为恐惧，所以才不敢生出背叛组织的想法。
其实黑衣组织不指望明美做什么，只需要她乖乖地当一个牵制雪莉的人质。看在雪莉的面子上，黑衣组织甚至没有追究明美把赤井带进组织的过错。但一旦明美想要脱离组织，甚至胆大包天的想要带走雪莉，组织肯定会杀掉她。
赤井不由得想起琴酒——负责捕杀叛徒的鹰犬。那个家伙肯定做梦都想杀掉他吧？
想不明白为什么明美对他念念不忘，先不说离开黑衣组织的两年，他们没有联系过，而且在他的身份暴露前，他就和明美分手，与琴酒搅在一起了。想了半天，他只能认为是明美从小没法正常和人交往，才会对初恋格外看重，这样一想就更加愧疚了。
他是不可能和明美复合的，但应该为她做些什么……不知道明美想要用什么方法离开黑衣组织，他是否能帮上忙。
赤井不敢给明美回短信。明美的生活一直被监视着，寄给雪莉的书信都会先被过滤一遍，也不知道她的手机有没有被监控。如果被黑衣组织发现他们有联系，明美等不到被追究想要逃跑的问题，就要被当作老鼠杀掉了。
原来黑衣组织对明美的监控没有那么严格，要事无巨细的盯住她的一举一动，甚至连短信都要监视，那要投入的精力太多了，黑衣组织不可能在一个外围成员身上浪费那么多人力。
这也是原著中明美还能向组织提出交易，没有一开始就被当作叛徒干掉，组织也没有利用她去联络赤井。但是现在琴酒要求严密监控明美，自然能够知道她发出了那条短信。比起内容，他的第一反应是赤井居然没有换手机号！
因为平时大多用电子邮箱联系，所以有赤井手机号的人很少。琴酒也有，但他觉得赤井暴露之后，肯定会把这个手机号注销掉。
简直胆大包天。
琴酒出于私心把这个消息压了下去，他不着急出手，他倒要看看赤井会不会去救前女友。
照原来，赤井不可能因为一条短信就冒着风险去接触明美的，但他为了勾搭琴酒把明美甩了这点实在太渣了，所以他想要有所补偿。
而此时柯南已经成功入住毛利侦探事务所，用毛利小五郎作掩护继续当侦探，但毛利是个胡涂侦探，利用他来收集黑衣组织的情报太没希望了。柯南甚至觉得，他当高中生侦探的时候，接受到的委托质量还更高。他真的有办法变回去吗？
柯南破了几个案子后，毛利终于有了些名气，接到的委托变多了，于是他终于遇到了几个手段比较高的案子，但可惜的是和黑衣组织没有关系。对小学生身份的不适应、对未来的焦虑，这些都给了他太多压力，以至于他平时无法集中注意力，不管是上课还是跟着毛利完成委托，他都心烦意乱的。
在某天，一个打扮有点土，但很漂亮的女孩来到了毛利侦探事务所，要求毛利帮忙寻找她失踪的爸爸。柯南对寻人委托不是很感兴趣，他更喜欢那种需要解密的类型，但有案件总比没案件好。小兰对雅美展现出了极大的同情，比毛利和柯南都要积极，而且凭借极佳的运气，瞬间就从人群中找到了广田。
之后简单的寻人委托却变成了谋杀案，柯南从种种不对劲中嗅出了味道，联系到了几天前的十亿元银行抢劫案，不过此刻他没想到这件事会和他心心念念的黑衣组织有关。
明美向组织提出要带着雪莉脱离组织的时候，申请被提交到了琴酒那里。其实谁都知道这是异想天开，但因为涉及到雪莉，所以还是报到了琴酒那。琴酒提出，明美能把十亿元抢来，就同意放她们姐妹走。琴酒也没想到明美居然相信了，于是还贴心地帮她找了两个搭档。
琴酒根本不在乎那十亿，他随便做笔交易就要几亿。按照以前的风格，他只需要等明美把钱拿来的时候，把明美杀掉就行了。但现在他的关注重点是赤井会不会跟明美一起来。
明美找到广田后就打算拿钱去给琴酒，但高大男人把广田勒死了，把钱拿回了酒店。明美和这两个搭档都不认识，彼此不知道底细，她不能暴露自己黑衣组织成员的身份，所以她只能寻找机会给高大男人下安眠药。
明美趁高大男人去玩小钢珠的时候，用客房服务叫了一瓶红酒，准备把琴酒给她的安眠药用针筒注入到酒里。她知道高大男人很喜欢喝酒，在获得大把钱的喜悦下，肯定会大喝特喝。
门被敲响了，明美去开门。外面站着一个穿着酒店服务员制服的男人，帽子下面是一张帅气的脸。明美惊诧地看着他：“大君！”她发短信的时候没有抱多少信心，只不过是为了完成自己的遗憾，没想到赤井居然会出现！“你怎么会知道我在这里？”