西元2032年，一架超音速喷射机行经西太平洋上空。
  少年很纳闷，自己为何会被国安局局长带到这种异乡之地。
  随后他得知，整起事件的原因要追溯到二十世纪时，美、苏两大国进行的一项秘密实验……
  冷战期间，美，苏两大国互相进行军备、太空竞赛，其中包含一项不为人知的「人类未知能力开发计画」，期望能发掘超能力者以投入军事用途。
  然而，实验却出现了意外。
  他们发现一种特殊能力者，其出现毫无规律，与国家、种族、信仰、血缘、性别全无关係，机率大约是六千万分之一。这种能力者异常强大，任一个都具备核弹级别的力量。由于他们的虹膜会随着心情而改变顏色，因此被命名为——「彩虹眼能力者」。
  为了防止世界被颠覆，各国政府决定放下嫌隙、彼此合作，要将这些潜在乱源一个都不留地全部消灭。
  此计画名为——「彩虹猎人」！
  ……你可曾还记得你是谁？
  以此宣告——吾等威德居汝麾下，眾生命运寄汝剑上！
  无论是否愿意，世界都会改变！